Meine Situation unter XP SP3 und v5.0.18.2:
Ich glaube, ich habe eine ähnliche bzw. sogar die exakte Situation unter v5.0 beobachtet. Kannst du es kurz mit v4.2 testen?
Edit:
Ich habe verstanden, woran das liegt.
Wenn man über das Hauptmenü "Optionen | S/MIME und TLS..." -> "Interne Implementierung" wählt, dann bekommt man im Adressbuch nur die interne Zertifikatsdatenbank zu sehen, im Menü "Ansicht" wird also nur der Befehl "Zertifikatsdatenbanken" bzw. auf Englisch "Certificate Address Books" angezeigt.
Stellt man hingegen "Microsoft Crypto API" als S/MIME Engine ein, bekommt man im Adressbuch im Menü "Ansicht" nur den Befehl "Windows-Zertifikate speichern..." bzw. auf Englisch "Windows Certificate Store" zu sehen.
Es gilt also die "entweder-oder" Regel, nur dass diese in v5.0 nicht richtig zu funktionieren scheint, denn dort bekommt man zunächst beide Befehle zu sehen. Hier ist der entsprechende BT-Thread dazu: #0008672: "Windows Certificate Store" menu item disappears.
Edit #2:
Wie es scheint, besteht dieses Problem bereits seit v5.0.0.132 Beta: #0008369: Address Book : Menu entry "Windows Certificate Store" is enabled, even Internal SMIME is selected.